Program utama di jenjang SD adalah memberikan bekal dalam pembentukan sikap dasar yang Islami dalam bentuk penanaman aqidah-akhlaq yang meliputi pengetahuan dasar tentang Iman, Islam dan Ihsan; pengetahuan dasar tentang akhlaq yang terpuji dan tercela; kecintaan pada Allah dan Rasul-Nya; kebanggaan terhadap Islam dan semangat memperjuangkannya.

Selain pembentukan sikap dasar yang berkait dengan penanaman aqidah-akhlaq, pendidikan di jenjang SD juga menitikberatkan pada pembiasaan berbudaya Islam seperti gemar beribadah, gemar belajar, displin, kreatif, mandiri, hidup bersih dan sehat, serta adab-adab Islam.

Secara akademis pendidikan di jenjang SD mengarahkan kepada para peserta didik untuk memiliki kemampuan akademis (penguasaan ilmu), mampu berbahasa asing (Inggris dan Arab) tingkat dasar, dan dapat melanjutkan ke SMP yang diinginkan.